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上海交通大学孟和团队在《自然通讯》发表骆驼基因组图谱文章

日期:2018-11-07

2012年11月13日,上海交通大学农业与生物学院孟和领衔的项目组由内蒙古农业大学、上海交通大学、中国科学院上海生命科学研究院、南开大学等33个研究单位组成,近历时2年时间完成了世界首例双峰驼全基因组序列图谱绘制和解析工作,成果在线发表在Nature子刊《Nature Communications》(DOI: 10.1038/ncomms2192),同时国际知名生物数据库GenBank将骆驼基因组数据向全球首次公开释放(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AGVR00000000)。同日,《Nature》网站以“Bactrian camel genome holds survival secrets”为题目进行了报道和点评,并在显要位置刊登骆驼照片。其后,科学新闻网、澳大利亚新闻网、法新社等知名媒体以进行了报道。 

双峰驼(bactrian camels)属于哺乳动物偶蹄目(Artiodactyla)、胼足亚目(Tylopoda)、骆驼科(Camelidae)、骆驼属(Camelus)。中国和蒙古国是世界上双峰骆驼主要栖息地。野生双峰驼是世界上仅存的骆驼属野生种,由于人类活动干扰和自然环境不断恶化,野骆驼数量急剧减少,目前仅存880峰左右比大熊猫要少得多。近年来,世界自然保护联盟(IUCN)已将野生双峰驼作为濒危物种列入红皮书,国际贸易公约(CITES)将其列为Ⅰ级濒危物种,我国也把野骆驼列为国家一级保护动物。尽管如此,野生双峰驼仍然面临着濒于灭绝的危险境地。由于骆驼长期生活在干旱、寒冷的荒漠地区,经过长期的自然选择,具有许多其它动物所不具备的生理特性。骆驼具有极强的耐饥渴能力、对植被具有超强的适应力以及特殊的免疫系统。尽管我们观察到了骆驼这些优良特性,但对其形成和作用机理了解的很少,许多问题都悬而未决。

此次,课题组对一个八岁的野生雄性双峰驼及一个六岁的阿拉善双峰驼进行全基因组序列测定和系统分析。基因图谱分析显示,双峰驼全基因组大小为2.38 Gb, 共编码20,821基因;系统发育分析显示在已完成基因组测序的物种中,双峰驼同牛遗传关系最近,并在5500–6000万年前有最近的共同祖先;同时能量存储和自我保护相关代谢通路中的基因处于加速进化状态,特别胰岛素通路相关基因的适应性进化可以解释骆驼高胰岛素抗性;野骆驼和家骆驼的比较显示,许多嗅觉受体在家骆驼中的杂和率显著较低,表明驯养与嗅觉有很大关系;课题组同时解析了双峰驼解毒基因和免疫球蛋白可能的遗传分子特征。

双峰驼全基因组图谱的成功绘制和破译,为了解骆驼特殊生活习性和生理特性,解释骆驼在极端环境下生存能力的分子机制提供了重要参考,骆驼特殊的代谢特性可能会使其成为一种研究代谢综合症的新型模式生物。项目所取得的成果将会对野生骆驼保护和家养骆驼品种改良起重要指导,对骆驼产业的健康发展起到积极的推动作用。 

 

 Nature主页对骆驼基因组文章的报道和点评

 

文章链接:http://www.nature.com/ncomms/journal/v3/n11/full/ncomms2192.html

新闻链接:

Nature News http://www.nature.com/news/bactrian-camel-genome-holds-survival-secrets-1.11807

science news

http://esciencenews.com/sources/physorg/2012/11/13/camel.dna.shows.secrets.hump.backed.survivor

News.com.au

http://www.news.com.au/breaking-news/world/camel-dna-shows-secrets-of-survivor/story-e6frfkui-1226516287466

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